Второе поколение Octavia было представлено на суд публики в 2004 году. Автомобиль приобрел новую внешность и кучу новых технологий, которые также применяют на немецких автомобилях Volkswagen. Внешность же новой Октавии стала очень похожей на Пассат пятого поколения.
Увидев автомобиль сразу можно отметить обновленный дизайн передней и задней части. New Octavia получила новую головную оптику и передний бампер с широким воздухозаборником. Визуально автомобиль стал гораздо выше и шире. Дизайн автомобиля получился солидным и респектабельным. Теперь Octavia стала выделяться среди других автомобилей. Интерьер также был переработан.
Габариты новой Октавии составляют: 4,572 м в длину, 1,769 м в ширину и 1,462 м в высоту. Объем багажного отделения у хэтчбэка составляет 560 л, но при сложенных спинках задних сиденьй, он увеличивается до 1350 л. Через примерно полгода после появления хэтчбэка был представлен универсал Skoda New Octavia Combi, который тоже обладает багажником больших размеров - он вмещает от 580 до 1620 л. Помимо внушительного багажника, в Octavia предусмотрено множество отделений для мелочей. Одним из многочисленных достоинств новой Octavia является погрузочная высота, которая была уменьшена с 696 до 674 мм по сравнению с предыдущим поколением.
Линейка силовых агрегатов представлена шестью двигателями: четыре бензиновых и два дизельных. От предыдущей версии новинка унаследовала два бензиновых двигателя объемом 1,4 л (75 л. с.) и 1,6 л (102 л. с.), а также 1,9-литровый турбодизель TDI (105 л. с.). Но помимо этого автомобиль получил три новых двигателя от концерна Фольксваген, два из них отличаются прямым впрыском FSI объемом 1,6 л (116 л. с.) и 2,0 л (150 л. с.), а третий - TDI объемом 2,0 л и мощностью 140 л. с. Автомобиль агрегатируется 5-ти или 6-ти ступенчатая механическая КПП. Также доступен 6-ступенчатый «автомат» и роботизированная коробка DSG.
Все New Octavia оснащаются системой бортовой диагностики EOBD. Эта система существенно облегчает задачу определения неисаправностей на СТО. Эта система анализирует отработанные газы и если какой-то элемент привышает норму, то на панели приборов зажигается лампочка.
Автомобиль получил новую подвеску - передняя типа McPherson, заднюю – четырехрычажную. Гидроусилитель руля уступил место электрическому, который способен изменять усилие на рулевом колесе в зависимости от скорости.
Модель предлагается, каа и раньше, в трех версиях: Classic, Ambiente и Elegance. В базовую комплектацию Classic входят две фронтальные и две боковые подушки безопасности, ABS, Brake Assistant, дисковые тормоза всех колес, центральный замок, кондиционер, рулевая колонка, длина и угол которой изменяются. Список дополнительного оборудования включает в себя: ксеноновые фары, навигационную систему, ESP, 2-ухзональный климат контроль.